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环形DNA测序示意图。
Devang Mehta/ University of Alberta 研究人员将工具发布在网上,并附有在实验室和电脑上测序操作的步骤说明,供世界各地同行使用。
环形DNA在细菌和病毒中很常见。
最近,科学家在人体和植物细胞核内也发现了这种DNA,也称为染色体外环状DNA(eccDNA)。
研究负责人梅塔(Devang Mehta)说,科学家对这类型的DNA了解有限,现在发现它们在癌细胞中也常见,可能和癌细胞快速繁殖的能力相关。
科学家开始调查这种DNA在癌细胞内所扮演的角色,但缺乏对其研究和测序的高效工具。
梅塔说:“我们设计了一套新的分子生物学方法和一种新的生物信息学算法,终于可以获得整套eccDNA信息。
我们的方法让我们能够对这些分子完整测序,给予我们和其他研究人员更好的细胞研究工具。
” 梅塔特别提到,这个工具可能对农业科学家很有帮助,因为很多感染农作物的病毒都具有环形DNA。
这份研究近期发表在《自然-实验室指南》(Nature Protocols)上。